Flore intestinale : le duel bactéries-virus

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Notre flore intestinale est naturellement composée de bonnes bactéries, essentielles à nos défenses immunitaires. Pourtant, selon des chercheurs français de l’INRA, ces bactéries hébergent aussi des virus probablement à l’origine de certains déséquilibres de la flore intestinale.

Plus de 200 espèces bactériennes colonisent notre microbiote intestinal. La plupart d’entre elles hébergent des virus « dans un état dormant ». Ces bactériophages participent à l’évolution du microbiote. Ils ont en effet la capacité de « se réveiller pour détruire leur hôte et aller infecter d’autres bactéries », précisent les scientifiques de l’Institut national de la recherche agronomique (INRA).

En cherchant plus loin, ces derniers sont parvenus à modéliser le comportement d’un virus infectant des bactéries dans l’appareil digestif de la souris pour mieux comprendre leur fonctionnement. Pour les besoins de ce travail, les rongeurs étaient porteurs de deux souches bactériennes Escherichia coli, infectées par un virus bactériophage.

Une propagation intense

« De manière inattendue, ce bactériophage à l’état dormant dans Escherichia coli est hyperactif dans le tube digestif des souris : il se réveille 50 fois plus fréquemment qu’attendu ». Ainsi pendant deux jours, le virus se propage dans les bactéries et détruit progressivement celles situées dans son environnement. Mais « une fois sur cinq, au lieu de le détruire, il s’installe dans le nouvel hôte dans un état dormant, là encore beaucoup plus fréquemment qu’attendu ».

Ces résultats prouvent l’importance du rôle des phages dans l’équilibre du microbiote intestinal. Ces interactions intenses pourraient d’ailleurs être à l’origine de certains déséquilibres de la flore digestive. Mais les recherches doivent se poursuivre pour comprendre par quels mécanismes le phage dormant est en capacité de se réveiller puis de se propager dans le tube digestif.

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  Source : Institut national de la recherche agronomique (INRA), le 15 février 2016

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  Ecrit par : Laura Bourgault : Edité par : Dominique Salomon